又一場狂風驟雨隨著日出東方悄然逝去，粉碎了反秦聯盟的刺殺行動，大秦帝國的統治表面上再次復歸于平靜，就仿佛昨夜什么也不曾發生。秦始皇運籌帷幄，對天下反秦勢力進行了一次成功的大清洗，迫使反秦勢力悄悄隱匿入廣闊的江湖之中，修養生息，由此引發的焚書坑儒事件，也使秦始皇得以成功鏟除異已，蜃樓也終于揚帆起航，開往海外去尋找長生不老藥。然而，大秦帝國千秋萬代的道路上仍然存在著諸多不可忽視的阻礙，一直對中原虎視眈眈的北方狼族，在長期的蟄伏之后，再次爆發起對中原的新一輪沖擊，日益頻繁的戍邊戰事，令帝國的鐵騎疲于應付。
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為躲避公輸家族霸道機關獸的追殺，天明、少羽、石蘭三人誤打誤撞，登上了停泊在海邊的蜃樓。這艘始終停留在遠處，可望而不可即的神秘巨艦，終于第一次近距離展現在三人面前，它華麗的外表之下，隱藏著天大的秘密。為躲開蜃樓上陰陽家弟子的追捕，三人逐漸深入到這座謎城一般的巨艦內部，開始了奇幻莫測的探險逃亡之旅。與此同時，庖丁順利從秦軍監獄脫逃，并為墨家眾人帶回了重要信息，張良連夜制定出了第一步行動計劃，青龍計劃由此緩緩拉開序幕。蜃樓上，天明等人迷失在奇異詭譎的無盡回廊之中，正在不知所措的時候，竟是高月的身影出現在遠處。桑海城郊，扶蘇公子在一次出巡途中，遭遇刺客伏擊。李斯奉命追查謀逆真兇，卻發現種種蛛絲馬跡都將嫌疑的矛頭指向了小圣賢莊。博浪沙前，風雨欲來，如利箭在弦，一觸即發。而機緣巧合之下，天明和少羽卻發現了更加令人震驚的秘密。風卷雨擊里，歷史默然轉身，亂世的帷幕，砰然落下。他說這片土地上我才是君臨天下的真正王者，而他們說，即使注定了這條道路鋪滿荊棘與鮮血，我們仍將繼續前行。你的執念阻擋不住俠者通往光明的大道。誰才是最終掌握乾坤的那個人，這不是句點，僅只是又翻過了新的一頁篇章。
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自從機關城崩塌，墨家抵抗勢力幾乎被全部清除。秦帝國又回到太平盛世的迷夢中……咸陽宮中的嬴政一邊動用無數勞工營造萬里長城，一邊進行著一些更為精密的計劃?，F在這個計劃已經接近完成，由陰陽家協助完成的巨艇“蜃樓”已經建造完畢。它壯麗精絕的身姿浮現海平面彼端，宛如人人夢想中的海上仙山。為了解開巨艇“蜃樓”的疑團，各家各派勢力慢慢匯聚到這座平靜的海邊小城。此時，故事主角天明和少羽為了避開秦兵追捕，正在儒家莊園學習和生活。而接下來各種奇異事件在此地發生，小城的平靜也被完全打破。所有的生死仇，家國恨，都將在那個時刻凝結。所有人的目光，都將在那個地點匯聚！蕓蕓眾生不過是一塊塊城磚，用來鑄造帝國的萬里長城。
公元前222年，秦發兵六十萬攻楚，楚軍節節敗退。亂軍之中，日后的名將之星蒙恬（蒙武之子）與未來的西楚霸王少羽第一次在沙場相遇。楚軍寡不敵眾，情況危急萬分，少年霸王與帝國將星的初次交鋒，勝負難測……兩年之后，秦滅六國，統一中國，成為歷史上第一位帝王。然而，亂世并未結束，一股強大的力量正在為顛覆大秦而崛起。他們分別是墨家、儒家、道家、法家、兵家、縱橫家、陰陽家、醫家、農家，歷史上稱之為諸子百家。如今，天下反秦勢力最后的堡壘——墨家機關城，正遭遇三百年來最大的一次危機。盜跖雖然成功脫出，趕往求援，卻被一神秘少女攔住去路。與此同時，墨家巨子率領各家英雄在趕往機關城途中，也遭到了陰陽家高手出其不意的暗襲。機關城中，身中劍傷的蓋聶揮劍斬向身后…… 十二年后，縱與橫再次交鋒，鬼谷的宿命之戰，終將在此有一個了結！墨家機關城會否就此陷落？墨家眾人的命運將何去何從？天明的面前究竟還有多少荊棘之路在等待著他？被陰陽家虜去的高月又會有何遭遇？要以孤家寡人對抗諸子百家，嬴政能有幾分勝算？在這動蕩的亂世中，誰才能成為真正的王者？
《夜盡天明》開篇便是大鐵錘與隱蝠的激戰，之后便是高漸離與雪女聯手戰勝了隱蝠，而此時，衛莊的手下黑麒麟已經化妝成大鐵錘手下潛如墨家機關城。黑麒麟打傷大師奪得機關城內部構造圖交給衛莊，衛莊命令黑麒麟在機關城核心的中心水池下毒，之后，黑麒麟化妝成蓋聶暗算徐夫子，不但下毒成功，而且使得高漸離對蓋聶生疑，將其軟禁在房間內。太陽升起，觸動了黑麒麟下在水池中的鴆羽千夜，墨家機關城內頓時飄滿毒氣，墨家弟子死傷慘重。衛莊等人攻入機關城，與高漸離、端木蓉等人展開激戰。而此時，天明、少羽、月兒三人進入墨家機關城禁地，闖過機關虎跳之后來到了袁飛處，由于少羽的恐高，天明在闖機關時與月兒一起不慎落入深谷，生死未卜。高漸離等人躲入墨家墨核，被衛莊團團圍困，墨家正遭遇三百年來最大的浩劫……
天下雖定，亂世未絕。天下第一劍客，始皇帝的近衛——蓋聶，攜故人之子——荊天明，為躲避秦始皇的追殺，踏上了荊棘密布的旅程。此刻，年少的天明對自己的身世以及未來將要經歷的一切仍然一無所知，命運之手卻已將一幅絢爛至極的畫卷在其腳下展開。秦國邊界，殘月谷，蓋聶一人一劍，盡屠300大秦鐵騎精兵。這位天下第一劍客以滿身傷痕告訴年少的天明何謂真正的強者。消息傳來，皇帝震怒，勒令宰相—李斯務必鏟除一切抗秦勢力。李斯提出以江湖對江湖的所謂以毒攻毒的策略。鬼谷傳人，原韓國貴族—衛莊，20年前（事實上應該是十五年，推算那時候正是歷史上蓋聶比武奪冠出名的時候）為同門師兄蓋聶所敗，一生所愿便是擊敗師兄，奪得天下第一劍的名號。為此，其不惜肉身，修煉鬼谷派的禁忌秘術，實力已是深不可測。李斯便以蓋聶作餌，誘衛莊出山。逃亡路上，天明結識了楚國大將之后—少羽，墨家眾高手，還有身世成謎的少女高月等人。衛莊手下的四大天王奇招迭出，對眾人步步追殺。天明歷經磨難，憑借過人的機智與勇氣，終于一一挫敗對手。怎奈衛莊處心積慮，處處設局，天明和蓋聶最終還是被逼入絕境。衛莊謀劃這一切的目的就是要逼迫蓋聶和自己進行一場真正的決斗。一場等待了20年的宿命之戰，在鬼谷派的縱橫兩大弟子之間無可避免地爆發。
